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Bacterial 16S rDNA Clone Library Construction Kit
品牌Code No.包装量价格说明书
TakaraR16020 次2,000 元



制品内容(20次量)

1. Tks Gflex DNA Polymerase*1(1.25 units/μl)40 μl
2. 2×Gflex PCR Buffer (Mg2+, dNTP plus)*1
1,000 μl
3. pBackZero-alpha linear vector*2(50 ng/μl)20 μl
4. 16S-FA/16S-R3 PCR primer Mix*3(10 pmol/μl each)40 μl
5. DNA Ligation Kit <Mighty Mix>*4
150 μl
6. sequencing primer BlaM1(10 pmol/μl)30 μl
7. sequencing primer BlaRV(10 pmol/μl)30 μl
8. DNA free H2O
1 ml×2
9. Positive Control DNA*5(1 ng/μl)10 μl
*1 与Tks Gflex DNA Polymerase(Code No. R060A)中含有的酶和Buffer相同。PCR反应40次量。可进行20次检测样品的扩增反应和各10次阳性对照和阴性对照反应。
*2 在多克隆位点被切断为具有平滑末端的线性载体。
*3 16S-FA/16S-R3 PCR primer Mix 是在扩增16S rDNA的通用引物27f和1492r的5’末端附加了碱基序列的引物。本试剂盒不能使用没有附加碱基序列的通用引物27f和1492r。
*4 与DNA Ligation Kit <Mighty Mix>(Code No. 6023)相同。
*5 在大肠杆菌JM109的基因组DNA两端附加了16S 27f/1492r primer序列后克隆的质粒DNA。使用16S-FA/16S-R3 PCR primer Mix进行PCR时,扩增片段大小为1068 bp。可进行10次阳性对照反应。


制品说明

本制品是基于有效进行环境细菌群落结构分析法之一的16S rDNA 克隆文库法而独自研发的16S rDNA克隆文库构建系统。可对环境细菌基因组DNA的16S rDNA的特定区域进行PCR扩增,高效克隆后构建克隆文库。
本制品中的PCR酶使用了可对粗提样品进行良好扩增的Tks Gflex DNA Polymerase,使用的载体是无需筛选阳性克隆的Positive Selection型pBackZero-alpha载体。因此,同传统的利用TA克隆构建的16S rDNA克隆文库相比,可更高效地制作文库。
使用本制品克隆效率在5×105 cfu/μg以上(注),不需要进行蓝白筛选可获得99%以上的阳性克隆。尽管本制品是平滑末端克隆,但获得的克隆99%以上都是插入片段为同一方向的克隆子,因此,利用载体上的序列作为引物可进行定向测序,也可对从PCR引物开始的碱基序列进行准确分析。
(注)克隆效率有时因实验条件不同会有所下降(比如E. coli感受态细胞的转化效率)。


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